eprintid: 43325
rev_number: 10
eprint_status: archive
userid: 12316
dir: disk0/00/04/33/25
datestamp: 2021-08-16 02:16:01
lastmod: 2021-08-16 02:16:01
status_changed: 2021-08-16 02:16:01
type: thesis
metadata_visibility: show
creators_name: Puspa Sari Khoirunissa, NIM.: 16640056
title: ANALISIS VARIASI GENETIK MULTIPLE SEROTYPE
VIRUS DENGUE DI ASIA TENGGARA BERDASARKAN
ENVELOPE GENE DALAM PERIODE TAHUN 2015-2018
ispublished: pub
subjects: BB
divisions: jur_bio
full_text_status: restricted
keywords: Asia Tenggara, Keanekaragaman Genetik, Laju Mutasi, SNP, Virus
Dengue.
note: Pembimbing : Jumailatus Solihah, S.Si.,
abstract: Virus dengue (DENV) merupakan penyebab infeksi dengue yang terjadi
pada manusia melalui
gigitan nyamuk Aedes aegypti yang telah terinfeksi dengue.
Asia Tenggara menjadi wilayah endemik DENV karena berada di kawasan tropis.
Sebagai virus RNA, DENV terus mengalami mutasi. Tujuan dari penelitian ini adalah
mengetahui keragaman genetik, persebaran dan juga laju mutasi multiple serotipe
DENV
yang tersebar di negara-negara Asia Tenggara berdasarakan sekuens gen
envelope. Hasil dari multiple alignment menujukan sekitar 557 hingga 648 variabel
basa nukleotida yang berubah berdasarkan hasil alignment. Keragaman genetik yang
dihasilkan AMOVA menunjukan persentase distribusi antar populasi DENV-1 lebih
rendah dibandingkan persentase dalam populasi, akan tetapi sebaliknya yang terjadi
pada DENV-2,
DENV-3 dan DENV-4 dimana nilai persentase antar populasi lebih
tinggi dibandingkan dengan nilai persentase dalam populasi. Hasil persebaran dengan
PCoA secara garis besar terbagi menjadi tiga titik dimana terdapat hubungan antar
kekerabatan dengan jarak genetik yang searah, dapat dikatakan bahwa semakin tinggi
jarak
genetik maka semakin jauh kekerabatannya. Laju mutasi atau subtitusi gen
envelope pada keempat serotipe DENV yang dihasilkan dengan rekontruksi pohon
filogenetik secara garis besar menunjukan relative time antara 0,00 hingga 0,05.
date: 2021-01-22
date_type: published
pages: 78
institution: UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA
department: FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI
thesis_type: skripsi
thesis_name: other
citation:   Puspa Sari Khoirunissa, NIM.: 16640056  (2021) ANALISIS VARIASI GENETIK MULTIPLE SEROTYPE VIRUS DENGUE DI ASIA TENGGARA BERDASARKAN ENVELOPE GENE DALAM PERIODE TAHUN 2015-2018.  Skripsi thesis, UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA.   
document_url: https://digilib.uin-suka.ac.id/id/eprint/43325/1/16640056_BAB-I_IV-atau-V_DAFTAR-PUSTAKA.pdf
document_url: https://digilib.uin-suka.ac.id/id/eprint/43325/2/16640056_BAB-II_sampai_SEBELUM-BAB-TERAKHIR.pdf