eprintid: 43327
rev_number: 10
eprint_status: archive
userid: 12316
dir: disk0/00/04/33/27
datestamp: 2021-08-16 02:33:27
lastmod: 2021-08-16 02:33:27
status_changed: 2021-08-16 02:33:27
type: thesis
metadata_visibility: show
creators_name: Nur Hasanah, NIM.: 16640072
title: ANALISIS IN SILICO KERAGAMAN BAKTERI
METILOTROF PADA MULUT MANUSIA
ispublished: pub
subjects: BB
divisions: jur_bio
full_text_status: restricted
keywords: Gen 16S rRNA, metilotrof, mulut manusia, dan pohon filogenetik
note: Pembimbing : Jumailatus Solihah, S. Si.
abstract: Metilotrof merupakan bakteri yang mampu memanfaatkan senyawa karbon tunggal 
sebagai sumber energi dan sumber karbon untuk pertumbuhannya. Beberapa penelitian
telah menunjukkan bahwa bakteri metilotrof dapat ditemukan di beberapa habitat, bahkan
sebagai mikrobiota normal pada mulut manusia. Berbagai strain dari kelompok
Actinobacteria (Brevibacterium, Gordonia, Leifsonia, Microbacterium, Micrococcus,
Rhodococcus), Proteobacteria (Achromobacter, Hyphomicrobium, Klebsiella,
Methylobacterium, Pseudomonas, Ralstonia, Variovorax) serta Firmicutes (Bacillus)
telah berhasil diisolasi dari mulut manusia sebagai bakteri metilotrof. Penelitian ini
bertujuan untuk melihat hubungan filogenetik bakteri metilotrof yang ditemukan pada
mulut manusia berdasarkan sekuens gen 16S rRNA. Sekuens gen 16S rRNA bakteri
metilotrof pada mulut manusia yang diperoleh dari database NCBI selanjutnya
dialigment menggunakan metode MUSCLE pada progam MEGAX. Konstruksi pohon
filogenetik dilakukan menggunakan progam MEGAX berdasarkan metode Maximum
Likelihood. Hasil konstruksi pohon filogenetik menunjukkan bahwa bakteri metilotrof
yang ditemukan pada mulut manusia terbagi menjadi 2 klade utama yang memisahkan
kelompok Firmicutes dari kelompok Actinobacteria dan Proteobacteria. Klade pertama
antara kelompok Actinobacteria dengan Proteobacteria masing-masing membentuk
percabangan yang berbeda. Analisis bootstrap terhadap percabangan pohon filogenetik
dilakukan dengan 500 pengulangan. Nilai bootstrap kelompok Proteobacteria relatif lebih
kecil dibandingkan dengan nilai bootstrap pada kelompok Actinobacteria dan Firmicutes.
date: 2020-12-18
date_type: published
pages: 102
institution: UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA
department: FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI
thesis_type: skripsi
thesis_name: other
citation:   Nur Hasanah, NIM.: 16640072  (2020) ANALISIS IN SILICO KERAGAMAN BAKTERI METILOTROF PADA MULUT MANUSIA.  Skripsi thesis, UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA.   
document_url: https://digilib.uin-suka.ac.id/id/eprint/43327/1/16640072_BAB-I_IV-atau-V_DAFTAR-PUSTAKA.pdf
document_url: https://digilib.uin-suka.ac.id/id/eprint/43327/2/16640072_BAB-II_sampai_SEBELUM-BAB-TERAKHIR.pdf