eprintid: 61429
rev_number: 11
eprint_status: archive
userid: 13169
dir: disk0/00/06/14/29
datestamp: 2023-10-18 08:08:18
lastmod: 2023-10-18 08:08:18
status_changed: 2023-10-18 08:08:18
type: thesis
metadata_visibility: show
contact_email: muchti.nurhidaya@uin-suka.ac.id
creators_name: Ulfa Nurrohmah Hikmawati, NIM: 16640070
title: ANALISIS IN SILICO PROTEIN PILI ADHESIN PADA BAKTERI PATOGEN PENYEBAB PENYAKIT PNEUMONIA SEBAGAI TARGET SENYAWA ANDROGRAPHOLIDE
ispublished: pub
subjects: BB
subjects: bak
divisions: jur_bio
full_text_status: restricted
keywords: andrographolide; docking molecular; homology modelling; pili adhesin; pneumonia
note: Pembimbing: Jumailatus Solihah, S.Si., M.Sc.
abstract: Pneumonia menjadi perhatian masyarakat karena menjadi salah satu penyebab utama morbiditas dan mortalitas anak berusia di bawah lima tahun. Klebsiella pneumoniae, Streptococcus pneumoniae dan Pseudomonas aeruginosa merupakan bakteri patogen paling banyak ditemukan pada pasien pneumonia. Infeksi bakteri terhadap inang salah satunya didukung oleh pelekatan protein pili adhesin yang dimiliki oleh bakteri terhadap sel host. Upaya pencegahan terjadinya penyakit pneumonia dapat dilakukan dengan menggunakan antibiotik senyawa alami dari Andrographis paniculata (daun Sambiloto), yaitu Andrographolide. Tujuan penelitian ini adalah mengetahui homologi protein pili adhesin bakteri patogen penyebab pneumonia dan mengetahui interaksi antara senyawa Andrographolide dengan protein pili adhesin bakteri patogen penyebab pneumonia. Penelitian ini menggunakan metode in silico. Homologi sekuen protein pili adhesin dilakukan dengan Multiple Sequence Alignment menggunakan software MEGA XI. Sedangkan untuk mengetahui interaksi protein pili adhesin dengan senyawa antibiotik Andrographolide dilakukan dengan cara Docking menggunakan software Pyrx. Hasil penelitian ini menunjukkan hasil persentasi identity matrix menggunakan Clustal Omega, bahwa isolat Klebsiella pneumoniae WP_253900340.1 memiliki similaritas tinggi terhadap 11 isolat bakteri lain yaitu isolat bakteri Streptococcus pneumoniae. Pada Filogenetic tree menunjukkan kedekatan evolusi dari bakteri yang diteliti. Klebsiella pneumoniae WP_253900340.1 berada satu klad dengan bakteri Streptococcus pneumoniae. Kedekatan evolusi tersebut diduga memiliki fungsi dan struktur yang sama. Protein target yang diteliti dapat dijadikan sebagai target antibiotik. Ditunjukkan pada nilai binding affinity yang rendah atau di bawah 0. Interaksi ligan senyawa Andrographolide dengan Klebsiella pneumoniae memiliki nilai binding affinity terendah yaitu -7,9 dan -7,8 interaksi Klebsiella pneumoniae dengan kontrol Tetrasiklin.
date: 2023-08-14
date_type: published
pages: 45
institution: UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA
department: FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI
thesis_type: skripsi
thesis_name: other
citation:   Ulfa Nurrohmah Hikmawati, NIM: 16640070  (2023) ANALISIS IN SILICO PROTEIN PILI ADHESIN PADA BAKTERI PATOGEN PENYEBAB PENYAKIT PNEUMONIA SEBAGAI TARGET SENYAWA ANDROGRAPHOLIDE.  Skripsi thesis, UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA.   
document_url: https://digilib.uin-suka.ac.id/id/eprint/61429/1/16640070_BAB-I_IV-atau-V_DAFTAR-PUSTAKA.pdf
document_url: https://digilib.uin-suka.ac.id/id/eprint/61429/2/16640070_BAB-II_sampai_SEBELUM-BAB-TERAKHIR.pdf