eprintid: 73664
rev_number: 14
eprint_status: archive
userid: 12243
dir: disk0/00/07/36/64
datestamp: 2025-10-13 04:32:13
lastmod: 2025-10-13 04:32:13
status_changed: 2025-10-13 04:32:13
type: thesis
metadata_visibility: show
contact_email: muchti.nurhidaya@uin-suka.ac.id
creators_name: Haqan Ridhaeva, NIM.: 21106040042
title: DESAIN VAKSIN HUMAN PAPILLOMAVIRUS (HPV) TIPE 39 BERBASIS PEPTIDA L1 DENGAN METODE IMUNOINFORMATIKA
ispublished: pub
subjects: 510
divisions: jur_bio
full_text_status: restricted
keywords: Docking Molekuler; Imunoinformatika; Prediksi Epitope; Permodelan Struktur Protein; Vaksin Berbasis Peptida.
note: Jumailatus Solihah, S.Si., M.Biotech.
abstract: Human Papillomavirus (HPV) tipe 39 merupakan salah satu tipe HPV berisiko tinggi yang dapat menyebabkan kanker serviks, namun belum tercakup dalam vaksin komersial yang tersedia saat ini. Perbedaan struktur genetik, terutama pada protein kapsid utama L1, menyebabkan perlindungan silang dari vaksin tipe lain menjadi kurang efektif. Oleh karena itu, diperlukan desain vaksin spesifik terhadap HPV 39. Penelitian ini bertujuan untuk merancang kandidat vaksin berbasis peptida dari protein L1 isolat HPV 39 Indonesia (BRIN39) menggunakan pendekatan imunoinformatika. Penelitian dilakukan dengan menganalisis sekuens protein L1 dari isolat HPV 39 Indonesia (BRIN39) dengan 38 isolat complete genome global tipe 39 yang terdapat di database NCBI, 19 isolat complete cds global, dan 5 isolat HPV tipe lain yang ditemukan di Indonesia. Penyelarasan sekuens dan analisis filogenetik dilakukan menggunakan MEGA11, pemodelan struktur 3D BRIN39 menggunakan Swiss-Model, prediksi epitope sel T dan sel B dilakukan dengan IEDB. Epitope terpilih dievaluasi berdasarkan sifat antigenik, toksisitas, dan alergenisitas, kemudian dianalisis konservansinya dan cakupan populasi HLA-nya. Evaluasi interaksi epitope dengan HLA-A*11:01 dan HLA-DRB1*15:01 dilakukan melalui molecular docking menggunakan GalaxyPepDock, dengan visualisasi struktur menggunakan Discovery Studio, analisis konservasi epitope, dan cakupan populasi epitope. Berdasarkan hasil tersebut, beberapa epitope memiliki afinitas ikatan yang tinggi, nilai prediksi struktural yang akurat, serta potensi imunogenik yang baik dan cakupan populasi yang luas. Temuan ini menunjukkan bahwa pendekatan imunoinformatika dapat digunakan untuk mengidentifikasi kandidat epitope spesifik HPV 39 yang menjanjikan untuk dikembangkan lebih lanjut sebagai vaksin peptida yang aman, efektif, dan spesifik terhadap populasi Indonesia dan global.
date: 2025-08-20
date_type: published
pages: 117
institution: UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA
department: FAKULTAS SAINS DAN TEKNOLOGI
thesis_type: skripsi
thesis_name: other
citation:   Haqan Ridhaeva, NIM.: 21106040042  (2025) DESAIN VAKSIN HUMAN PAPILLOMAVIRUS (HPV) TIPE 39 BERBASIS PEPTIDA L1 DENGAN METODE IMUNOINFORMATIKA.  Skripsi thesis, UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA.   
document_url: https://digilib.uin-suka.ac.id/id/eprint/73664/1/21106040042_BAB-I_IV-atau-V_DAFTAR-PUSTAKA.pdf
document_url: https://digilib.uin-suka.ac.id/id/eprint/73664/2/21106040042_BAB-II_sampai_SEBELUM-BAB-TERAKHIR.pdf