ANALISIS IN SILICO KERAGAMAN BAKTERI METILOTROF PADA MULUT MANUSIA

Nur Hasanah, NIM.: 16640072 (2020) ANALISIS IN SILICO KERAGAMAN BAKTERI METILOTROF PADA MULUT MANUSIA. Skripsi thesis, UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA.

Preview	Text (ANALISIS IN SILICO KERAGAMAN BAKTERI METILOTROF PADA MULUT MANUSIA) 16640072_BAB-I_IV-atau-V_DAFTAR-PUSTAKA.pdf Download (4MB) | Preview
	Text (ANALISIS IN SILICO KERAGAMAN BAKTERI METILOTROF PADA MULUT MANUSIA) 16640072_BAB-II_sampai_SEBELUM-BAB-TERAKHIR.pdf Restricted to Registered users only Download (4MB)

Abstract

Metilotrof merupakan bakteri yang mampu memanfaatkan senyawa karbon tunggal sebagai sumber energi dan sumber karbon untuk pertumbuhannya. Beberapa penelitian telah menunjukkan bahwa bakteri metilotrof dapat ditemukan di beberapa habitat, bahkan sebagai mikrobiota normal pada mulut manusia. Berbagai strain dari kelompok Actinobacteria (Brevibacterium, Gordonia, Leifsonia, Microbacterium, Micrococcus, Rhodococcus), Proteobacteria (Achromobacter, Hyphomicrobium, Klebsiella, Methylobacterium, Pseudomonas, Ralstonia, Variovorax) serta Firmicutes (Bacillus) telah berhasil diisolasi dari mulut manusia sebagai bakteri metilotrof. Penelitian ini bertujuan untuk melihat hubungan filogenetik bakteri metilotrof yang ditemukan pada mulut manusia berdasarkan sekuens gen 16S rRNA. Sekuens gen 16S rRNA bakteri metilotrof pada mulut manusia yang diperoleh dari database NCBI selanjutnya dialigment menggunakan metode MUSCLE pada progam MEGAX. Konstruksi pohon filogenetik dilakukan menggunakan progam MEGAX berdasarkan metode Maximum Likelihood. Hasil konstruksi pohon filogenetik menunjukkan bahwa bakteri metilotrof yang ditemukan pada mulut manusia terbagi menjadi 2 klade utama yang memisahkan kelompok Firmicutes dari kelompok Actinobacteria dan Proteobacteria. Klade pertama antara kelompok Actinobacteria dengan Proteobacteria masing-masing membentuk percabangan yang berbeda. Analisis bootstrap terhadap percabangan pohon filogenetik dilakukan dengan 500 pengulangan. Nilai bootstrap kelompok Proteobacteria relatif lebih kecil dibandingkan dengan nilai bootstrap pada kelompok Actinobacteria dan Firmicutes.

Share this knowledge with your friends :

Actions (login required)

View Item