ANALISIS VARIASI GENETIK MULTIPLE SEROTYPE VIRUS DENGUE DI ASIA TENGGARA BERDASARKAN ENVELOPE GENE DALAM PERIODE TAHUN 2015-2018

Puspa Sari Khoirunissa, NIM.: 16640056 (2021) ANALISIS VARIASI GENETIK MULTIPLE SEROTYPE VIRUS DENGUE DI ASIA TENGGARA BERDASARKAN ENVELOPE GENE DALAM PERIODE TAHUN 2015-2018. Skripsi thesis, UIN SUNAN KALIJAGA YOGYAKARTA.

Preview	Text (ANALISIS VARIASI GENETIK MULTIPLE SEROTYPE VIRUS DENGUE DI ASIA TENGGARA BERDASARKAN ENVELOPE GENE DALAM PERIODE TAHUN 2015-2018) 16640056_BAB-I_IV-atau-V_DAFTAR-PUSTAKA.pdf Download (3MB) | Preview
	Text (ANALISIS VARIASI GENETIK MULTIPLE SEROTYPE VIRUS DENGUE DI ASIA TENGGARA BERDASARKAN ENVELOPE GENE DALAM PERIODE TAHUN 2015-2018) 16640056_BAB-II_sampai_SEBELUM-BAB-TERAKHIR.pdf Restricted to Registered users only Download (3MB)

Abstract

Virus dengue (DENV) merupakan penyebab infeksi dengue yang terjadi pada manusia melalui gigitan nyamuk Aedes aegypti yang telah terinfeksi dengue. Asia Tenggara menjadi wilayah endemik DENV karena berada di kawasan tropis. Sebagai virus RNA, DENV terus mengalami mutasi. Tujuan dari penelitian ini adalah mengetahui keragaman genetik, persebaran dan juga laju mutasi multiple serotipe DENV yang tersebar di negara-negara Asia Tenggara berdasarakan sekuens gen envelope. Hasil dari multiple alignment menujukan sekitar 557 hingga 648 variabel basa nukleotida yang berubah berdasarkan hasil alignment. Keragaman genetik yang dihasilkan AMOVA menunjukan persentase distribusi antar populasi DENV-1 lebih rendah dibandingkan persentase dalam populasi, akan tetapi sebaliknya yang terjadi pada DENV-2, DENV-3 dan DENV-4 dimana nilai persentase antar populasi lebih tinggi dibandingkan dengan nilai persentase dalam populasi. Hasil persebaran dengan PCoA secara garis besar terbagi menjadi tiga titik dimana terdapat hubungan antar kekerabatan dengan jarak genetik yang searah, dapat dikatakan bahwa semakin tinggi jarak genetik maka semakin jauh kekerabatannya. Laju mutasi atau subtitusi gen envelope pada keempat serotipe DENV yang dihasilkan dengan rekontruksi pohon filogenetik secara garis besar menunjukan relative time antara 0,00 hingga 0,05.

Share this knowledge with your friends :

Actions (login required)

View Item